Υπεύθυνος Εργαστηρίου: Δημήτριος Λουκοβίτης, Αναπλ/της Καθηγητής
Χώρος Εργαστηρίου: Κτίριο Κ11
Τηλ: 26310 58260 – 58251
eΜail:
Ιστότοπος Εργαστηρίου: https://sites.google.com/g.upatras.gr/labofappliedgenetics/
Το Εργαστήριο Εφαρμοσμένης Γενετικής εξυπηρετεί διδακτικές και ερευνητικές ανάγκες στα γνωστικά αντικείμενα της Γενετικής, Πληθυσμιακής Γενετικής και Γενετικής Διατήρησης, Μοριακής και Ποσοτικής Γενετικής, Γονιδιωματικής και Βιοπληροφορικής Ανάλυσης.
Έχει ως κύριους στόχους:
α) την κάλυψη σε προπτυχιακό και μεταπτυχιακό επίπεδο των διδακτικών και ερευνητικών αναγκών του Τμήματος Αλιείας και Υδατοκαλλιεργειών, καθώς και άλλων ακαδημαϊκών μονάδων του Πανεπιστημίου Πατρών σε θέματα που εμπίπτουν στα γνωστικά αντικείμενα του εργαστηρίου,
β) την ανάπτυξη και προώθηση της συνεργασίας, στα πλαίσια εκπόνησης ερευνητικών έργων, με ερευνητικά κέντρα και ακαδημαϊκά ιδρύματα της ημεδαπής και της αλλοδαπής,
γ) την δημοσίευση ερευνητικών αποτελεσμάτων από ερευνητικά προγράμματα στα οποία το εργαστήριο συμμετέχει, σε εθνικά/διεθνή συνέδρια και σε έγκριτα επιστημονικά περιοδικά,
δ) την διοργάνωση ημερίδων, σεμιναρίων, συνεδρίων, διαλέξεων και άλλων επιστημονικών εκδηλώσεων και
ε) την παροχή υπηρεσιών γενετικών αναλύσεων προς τρίτους.
Εργαστηριακή Υποδομή
PCR θερμοκυκλοποιητές
Υδατόλουτρα
Επωαστικοί κλίβανοι
Σπεκτροφωτόμετρο
Φυγόκεντροι
Αυτόκαυστο
Elisa – plate reader
Συσκευές οριζόντιας και κάθετης ηλεκτροφόρησης νουκλεϊκών οξέων
Γενετικός αναλυτής για αλληλούχηση κατά Sanger και ανάλυση πολυμορφισμού μήκους (fragment analysis) ΑΒΙ 3500
Γενετικός αναλυτής για αλληλούχηση κατά Sanger και ανάλυση πολυμορφισμού μήκους (fragment analysis) ΑΒΙ 3130
Γενετικός αναλυτής για NGS (Next Generation Sequencing) αλληλούχηση Illumina iSeq100
Γενετικός αναλυτής για την αλληλούχηση ‘3ης Γενιάς (3rd Generation Sequencing)’ Oxford Nanopore Technologies MinION Mk1B
Ερευνητικές Δραστηριότητες
Γενετική ταυτοποίηση φυτικών και ζωικών οργανισμών
Μελέτες φυτικών και ζωικών οργανισμών για τον γενετικό χαρακτηρισμό ποικιλιών φυτικών ειδών, φυλών αγροτικών ζώων, φυσικών και εκτρεφόμενων πληθυσμών ιχθύων κ.α.
Γενετική ταυτοποίηση και μελέτη της ποικιλότητας μικροοργανισμών σε φυτικούς και ζωικούς οργανισμούς
Μελέτες Ποσοτικής Γενετικής και γενετική χαρτογράφηση ειδών ιχθύων και αγροτικών ζώων
Μελέτη της γενετικής αρχιτεκτονικής ποσοτικών χαρακτήρων, QTL (Quantitative Trait Loci) ανάλυση και GWAS (Genome-Wide Association Analysis) ανάλυση σε εκτρεφόμενα είδη ιχθύων και αγροτικών ζώων
Μελέτες της γενεαλογίας και των συγγενικών σχέσεων ατόμων ζωικών οργανισμών
Μελέτη και αξιολόγηση Προγραμμάτων Επιλογής για την γενετική βελτίωση ιδιοτήτων οικονομικής σημασίας σε εκτρεφόμενα είδη ιχθύων και αγροτικών ζώων
Παροχή Υπηρεσιών προς Τρίτους
Ταυτοποίηση (Dna Barcoding) σε Επίπεδο Είδους Ζωικών/Φυτικών Οργανισμών και Μικροοργανισμών
Μεταγενωμική Ανάλυση (Metagenomic Analysis) σε Δείγματα Τροφίμων, Νερού, Χώματος, Εντερικού Περιεχομένου, Κοπράνων κ.α. για την Ταυτοποίηση Ειδών Βακτηρίων, Μυκήτων κ.α., χρησιμοποιώντας Τεχνικές Αλληλούχησης 3ης Γενιάς σε Γονίδια Στόχους (π.χ 16s Rrna, Its)
Γενετικός Έλεγχος Νοθείας σε Ζωικά και Φυτικά Προϊόντα
Ιχνηλασιμότητα Πρώτων Υλών Τροφίμων Φυτικής και Ζωικής Προέλευσης με Μεθόδους Γενετικής Ανάλυσης
Αλληλούχηση pcr Προϊόντων (Sanger Sequencing)
Ανάλυση Πολυμορφισμού Μήκους pcr Προϊόντων (Fragment Analysis)
Αλληλούχηση Θραυσμάτων Dna Οποιουδήποτε Μήκους (Amplicon Sequencing) χρησιμοποιώντας Τεχνικές Αλληλούχησης 3ης Γενιάς
Γενεαλογικός Έλεγχος (Τεστ Πατρότητας) για την Αποτύπωση των Συγγενικών Σχέσεων σε Είδη Εκτρεφόμενων Ιχθύων (Τσίπουρα, Λαβράκι, Φαγκρί, Κρανιός) και Αγροτικών Ζώων
Γενετικός Χαρακτηρισμός (Genetic Screening) Γεννητόρων Υδατοκαλλιεργειών
Σχεδιασμός και Εφαρμογή Προγραμμάτων Επιλογής για την Γενετική Βελτίωση Ιδιοτήτων Οικονομικής Σημασίας σε Εκτρεφόμενα Είδη Ιχθύων και Αγροτικών Ζώων